フォルダ内のファイルが更新されたことを知る事はできますか？

可能です。アガサには、ファイルを新規又は更新した場合にメールでお知らせを受け取る機能があります。
こちらは、オプション機能となりますので、機能追加をご希望の場合は「お問い合わせの送信」よりお問合せください。